Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250 ms