Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms