Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PCDHGA1-201ENST00000378105 4069 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PITX2-213ENST00000616641 3102 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TTI2-201ENST00000360742 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC068831.1-202ENST00000557804 2159 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF221-201ENST00000251269 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 HPSE2-203ENST00000370552 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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ANKRD39Q53RE8 LY9-205ENST00000392203 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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ANKRD39Q53RE8 ERVV-1-201ENST00000602168 2202 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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