Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms