Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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