Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms