Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCK2Q16822 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms