Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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NDUFA9Q16795 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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NDUFA9Q16795 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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NDUFA9Q16795 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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NDUFA9Q16795 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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NDUFA9Q16795 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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NDUFA9Q16795 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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