Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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