Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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