Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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NCOA1Q15788 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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NCOA1Q15788 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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NCOA1Q15788 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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