Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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