Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TLR1Q15399 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms