Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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