Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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