Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms