Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms