Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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