Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPIDRQ14159 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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