Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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