Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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CDH18Q13634 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CDH18Q13634 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CDH18Q13634 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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