Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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