Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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