Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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