Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms