Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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ITGB3BPQ13352 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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ITGB3BPQ13352 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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ITGB3BPQ13352 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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ITGB3BPQ13352 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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ITGB3BPQ13352 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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ITGB3BPQ13352 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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