Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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