Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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