Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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