Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms