Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms