Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms