Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms