Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms