Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms