Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms