Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX1P78337 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms