Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP46P62068 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP46P62068 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP46P62068 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.1 ms