Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms