Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms