Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms