Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX1P48742 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms