Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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