Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPD2P43304 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPD2P43304 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms