Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms