Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms