Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms