Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms