Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO2P25791 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO2P25791 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO2P25791 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO2P25791 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO2P25791 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms