Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms